Diagnostiquer le syndrome de Dup15q
Comment les duplications du chromosome 15 sont-elles diagnostiquées?
Les tests génétiques recherchent des anomalies dans l'ADN telles que du matériel supprimé ou supplémentaire. Chaque chromosome a des régions ou des bandes uniques qui contiennent des gènes, et chaque bande est étiquetée numériquement. C'est là que les tests génétiques recherchent des bandes manquantes ou supplémentaires. Plusieurs types de tests sont utilisés pour examiner les chromosomes ou rechercher des preuves d'un dosage supplémentaire d'ADN de la région.
Tests génétiques utilisés pour aider à diagnostiquer le syndrome Dup15q :
Une puce à ADN ne peut pas faire la différence entre une duplication isodicentrique (idic) et une triplication interstitielle (2 copies supplémentaires adjacentes l'une à l'autre). Sur certains rapports de puces à ADN, le nombre total de copies peut être indiqué ; s'il est répertorié en 3 exemplaires au total, il peut être raisonnable de supposer qu'il est interstitiel. Pour être idique, il faudrait généralement qu'il y ait deux copies normales et deux copies miroir pour créer le chromosome supplémentaire. Il serait donc très peu probable d'avoir un identifiant avec 3 copies au total de la région. Le diagnostic est confirmé par des techniques cytogénétiques standard et une analyse FISH, qui confirme le diagnostic en distinguant le Dup15q des autres chromosomes marqueurs surnuméraires. Les duplications interstitielles du chromosome 15 peuvent être plus difficiles à détecter lors d'une analyse chromosomique de routine, mais sont clairement identifiables à l'aide d'une étude FISH 15q ou d'une micropuce/matrice clinique CGH. Des études moléculaires, telles que l'analyse microsatellite de l'ADN parental ou l'analyse de méthylation de l'ADN de l'enfant affecté, sont nécessaires afin de détecter le parent d'origine du Dup15q.
Cependant, la pratique courante consiste toujours à effectuer un FISH ou un caryotype pour confirmer tous les cas, car les chromosomes peuvent parfois agir de manière inattendue.
microarray
Les puces à ADN sont des tests ADN qui mesurent le « nombre de copies » des chromosomes. Ils détectent les duplications ou les délétions, appelées « variations du nombre de copies », pour tous les chromosomes et sont généralement capables de déterminer le nombre total de copies d'une région chromosomique présentes. Bien qu'ils donnent des limites plus précises pour la région dupliquée que les études chromosomiques, ils ne peuvent pas toujours distinguer les chromosomes int dup(15) et idic(15). Des études chromosomiques sont également généralement effectuées si la puce à ADN présente une duplication.
Étude du caryotype ou du chromosome
Une étude chromosomique ou caryotype est généralement réalisée à partir de sang ou lors d'une amniocentèse. Avec cette étude, les chromosomes sont comptés et les paires sont appariées, les chromosomes sexuels sont identifiés, puis le motif de bandes est examiné pour rechercher des signes indiquant qu'il pourrait y avoir des chromosomes perdus, supplémentaires ou réarrangés.
Test de POISSON
Un deuxième test appelé FISH, qui signifie Fluorescence In Situ Hybridization, est utilisé pour donner des informations plus précises sur l'ADN inclus dans une duplication. Ce test utilise un morceau d'ADN fluorescent qui marque un endroit spécifique sur le chromosome 15 pour déterminer s'il se trouve dans la duplication et, si oui, combien de copies il y a. Les duplications interstitielles du chromosome 15 peuvent être plus difficiles à détecter lors d'une analyse chromosomique de routine, mais sont clairement identifiables à l'aide d'une étude FISH 15q.
Test de méthylation
Le test de méthylation utilise une modification chimique de l'ADN pour distinguer si la duplication est sur un chromosome provenant de la mère ou du père. Le test a été développé pour être utilisé dans les syndromes de Prader Willi et Angelman, donc l'un de ces noms ou les deux sont souvent dans le nom du test.
Nombre de copies et gravité
Il existe un large éventail de gravité dans les problèmes de développement rencontrés par les personnes atteintes du syndrome Dup15q. Deux enfants présentant le même profil chromosomique Dup15q peuvent être très différents en termes de capacités. Les revues de la littérature scientifique ne montrent pas de corrélation évidente entre la taille de la région de duplication et la gravité des symptômes. Les risques génétiques pour les différents types de duplications du chromosome 15 ne sont pas les mêmes. Des informations complémentaires sont fournies sur la page pour chaque type de duplication. Les familles devraient toujours discuter des résultats de leurs études génétiques avec un professionnel en génétique pour garantir une interprétation précise.