Diagnose van het Dup15q-syndroom

Hoe worden duplicaties van chromosoom 15 gediagnosticeerd?

BandsGenetische tests zoeken naar afwijkingen in het DNA, zoals verwijderd of extra materiaal. Elk chromosoom heeft unieke regio's of banden die genen bevatten, en elke band is numeriek gelabeld. Dit is waar genetische tests zoeken naar ontbrekende of extra banden. Er worden verschillende soorten tests gebruikt om de chromosomen te onderzoeken of om aanwijzingen te zoeken voor een extra dosis DNA uit de regio.

Genetische tests die worden gebruikt om het dup15q-syndroom te diagnosticeren:

Een microarray kan het verschil niet zien tussen een isodicentrische (idische) duplicatie en een interstitiële verdrievoudiging (2 extra kopieën naast elkaar). Op sommige microarray-rapporten kan het totale aantal exemplaren worden vermeld; als het wordt vermeld als in totaal 3 exemplaren, kan redelijkerwijs worden aangenomen dat het interstitial is. Om idic te zijn, zouden er normaal gesproken twee normale kopieën en twee gespiegelde kopieën moeten zijn om het extra chromosoom te creëren. Het is dus hoogst onwaarschijnlijk dat er een idic is met in totaal 3 exemplaren van de regio. De diagnose wordt bevestigd door middel van standaard cytogenetische technieken en FISH-analyse, die de diagnose bevestigt door de dup15q te onderscheiden van andere overtollige markerchromosomen. Interstitiële duplicaties van chromosoom 15 kunnen moeilijker te detecteren zijn bij een routinematige chromosoomanalyse, maar zijn duidelijk identificeerbaar met behulp van een 15q FISH-onderzoek of klinische microarray/array CGH. Moleculaire studies, zoals microsatellietanalyse van ouderlijk DNA of methylatieanalyse van het DNA van het getroffen kind, zijn vereist om de oorspronkelijke ouder van de dup15q te detecteren.

De standaardpraktijk is echter nog steeds om een ​​FISH of karyotype te doen om alle gevallen te bevestigen, omdat chromosomen soms op onverwachte manieren kunnen werken.

microarray

Microarrays zijn DNA-testen die het "kopienummer" van de chromosomen meten. Ze screenen op duplicaties of deleties, "kopienummervariaties" genoemd, voor alle chromosomen en zijn doorgaans in staat om te bepalen hoeveel totale kopieën van een chromosomaal gebied aanwezig zijn. Hoewel ze preciezere grenzen geven voor het gedupliceerde gebied dan chromosomale studies, kunnen ze niet altijd onderscheid maken tussen int dup(15) en idic(15) chromosomen. Chromosomale studies worden meestal ook uitgevoerd als de microarray een duplicatie vertoont.

Karyotype of chromosoomonderzoek

Een chromosoomonderzoek of karyotype wordt meestal gedaan uit bloed of bij een vruchtwaterpunctie. Bij deze studie worden de chromosomen geteld en worden de paren op elkaar afgestemd, worden de geslachtschromosomen geïdentificeerd en vervolgens wordt het bandpatroon onderzocht om te zoeken naar tekenen dat er verloren, extra of herschikte chromosomen kunnen zijn.

VIS-test

Een tweede test genaamd FISH, wat staat voor Fluorescence In Situ Hybridization, wordt gebruikt om nauwkeuriger informatie te geven over het DNA dat in een duplicatie is opgenomen. Deze test gebruikt een fluorescerend stukje DNA dat een specifieke plek op chromosoom 15 markeert om te bepalen of het in de duplicatie wordt aangetroffen en zo ja, hoeveel exemplaren er zijn. Interstitiële duplicaties van chromosoom 15 kunnen moeilijker te detecteren zijn met routinematige chromosomale analyse, maar zijn duidelijk identificeerbaar met een 15q FISH-onderzoek.

Methyleringstest

De methyleringstest maakt gebruik van een chemische modificatie van het DNA om te onderscheiden of de duplicatie op een chromosoom is dat afkomstig is van de moeder of de vader. De test is ontwikkeld voor gebruik bij de syndromen van Prader Willi en Angelman, dus een of beide namen staan ​​vaak in de naam van de test.

Kopieer aantal en ernst

Er is een breed scala aan ernst van de ontwikkelingsproblemen die mensen met het dup15q-syndroom ervaren. Twee kinderen met hetzelfde dup15q-chromosoompatroon kunnen heel verschillend zijn wat betreft hun capaciteiten. Beoordelingen van de wetenschappelijke literatuur laten geen duidelijke correlatie zien tussen de grootte van het duplicatiegebied en de ernst van de symptomen. De genetische risico's voor de verschillende soorten chromosoom 15-duplicaties zijn niet hetzelfde. Voor elk type duplicatie vindt u op de pagina aanvullende informatie. Gezinnen moeten de resultaten van hun genetische studies altijd bespreken met een geneticus om een ​​nauwkeurige interpretatie te garanderen.