Diagnostisering av Dup15q-syndrom
Hur diagnostiseras duplikationer av kromosom 15?
Genetiska tester letar efter avvikelser i DNA som raderat eller extra material. Varje kromosom har unika regioner eller band som innehåller gener och varje band är märkt numeriskt. Det är här genetiska tester letar efter saknade eller extra band. Flera typer av tester används för att undersöka kromosomerna eller leta efter bevis för en extra dos av DNA från regionen.
Genetiska tester som används för att diagnostisera Dup15q syndrom:
En mikromatris kan inte se skillnaden mellan en isodicentrisk (idic) duplicering och en interstitiell tredubbling (2 extra kopior bredvid varandra). På vissa mikroarrayrapporter kan det listas det totala antalet kopior; om det är listat som totalt 3 kopior kan det vara rimligt att anta att det är mellansides. För att vara idic skulle det vanligtvis behöva finnas två normala kopior och två spegelkopior för att skapa den extra kromosomen. Så det skulle vara högst osannolikt att ha en idic med totalt 3 kopior av regionen. Diagnosen bekräftas med vanliga cytogenetiska tekniker och FISH-analys, som bekräftar diagnosen genom att särskilja Dup15q från andra övertalliga markörkromosomer. Interstitiell duplicering av kromosom 15 kan vara svårare att upptäcka på en rutinmässig kromosomanalys men är tydligt identifierbara med en 15q FISH-studie eller klinisk mikroarray/array CGH. Molekylära studier, såsom mikrosatellitanalys på föräldrarnas DNA eller metyleringsanalys på det drabbade barnets DNA, krävs för att upptäcka ursprungsföräldern till Dup15q.
Standard för praxis är fortfarande att göra en FISK eller karyotyp för att bekräfta alla fall, dock eftersom kromosomer ibland kan agera på oväntade sätt.
Mikroarrayer
Mikroarrayer är DNA-tester som mäter "kopiantalet" av kromosomerna. De undersöker för duplikationer eller deletioner, kallade "variationer av antal kopior", för alla kromosomerna och kan vanligtvis bestämma hur många totala kopior av en kromosomregion som finns. Även om de ger mer exakta gränser för den duplicerade regionen än kromosomstudier, kan de inte alltid särskilja int dup(15) och idic(15) kromosomer. Kromosomstudier utförs också vanligtvis om mikroarrayen visar en duplicering.
Karyotyp eller kromosomstudie
En kromosomstudie eller karyotyp görs vanligtvis från blod eller vid ett fostervattenprov. Med den här studien räknas kromosomerna och paren matchas, könskromosomerna identifieras och sedan undersöks bandmönstret för att leta efter tecken på att det kan finnas förlorade, extra eller omarrangerade kromosomer.
FISKTEST
Ett andra test som heter FISH, som står för Fluorescence In Situ Hybridization, används för att ge mer exakt information om DNA som ingår i en duplicering. Detta test använder en fluorescerande DNA-bit som markerar en specifik fläck på kromosom 15 för att avgöra om den finns i dupliceringen och, i så fall, hur många kopior det finns. Interstitiella duplikationer av kromosom 15 kan vara svårare att upptäcka vid rutinmässig kromosomanalys men är tydligt identifierbara med hjälp av en 15q FISH-studie.
Metyleringsanalys
Metyleringsanalysen använder en kemisk modifiering av DNA för att skilja om duplicering sker på en kromosom som kommer från modern eller fadern. Testet utvecklades för användning i Prader Willi och Angelman syndrom, så att ett eller båda av dessa namn ofta är i testets namn.
Kopieringsnummer och allvarlighetsgrad
Det finns ett brett spektrum av svårighetsgrad i de utvecklingsproblem som personer med Dup15q-syndrom upplever. Två barn med samma Dup15q-kromosommönster kan vara mycket olika vad gäller deras förmågor. Granskningar av den vetenskapliga litteraturen visar inte en uppenbar korrelation mellan storleken på dupliceringsregionen och symtomens svårighetsgrad. De genetiska riskerna för de olika typerna av duplikationer av kromosom 15 är inte desamma. Ytterligare information finns på sidan för varje typ av duplicering. Familjer bör alltid diskutera resultaten av sina genetiska studier med en genetikspecialist för att säkerställa korrekt tolkning.