Diagnostisera Dup15q syndrom

Hur diagnostiseras duplikationer av kromosom 15?

Genetiska tester letar efter avvikelser i DNA som raderat eller extra material. Varje kromosom har unika regioner eller band som innehåller gener och varje band är märkt numeriskt. Det är här genetiska tester letar efter saknade eller extra band. Flera typer av tester används för att undersöka kromosomerna eller leta efter bevis för en extra dos av DNA från regionen.

Genetiska tester som används för att diagnostisera dup15q syndrom:

En mikroarray kan inte se skillnaden mellan en isodicentrisk (idisk) duplicering och en interstitiell triplisering (2 extra kopior intill varandra). I vissa mircoarray-rapporter kan det ange det totala antalet exemplar, om det listas som tre totalt exemplar, kan det vara rimligt att anta att det är interstitial. För att vara idisk skulle det vanligtvis behöva finnas två normala kopior och två speglade kopior för att skapa den extra kromosomen. Så det skulle vara mycket osannolikt att ha en idik med totalt 3 exemplar av regionen. Diagnos bekräftas med standard cytogenetiska tekniker och FISH-analys, som bekräftar diagnosen genom att skilja dup3q från andra supernumerära markörkromosomer. Interstitiella duplikationer av kromosom 15 kan vara svårare att upptäcka vid en rutinmässig kromosomanalys men är tydligt identifierbara med hjälp av en 15q FISH-studie eller klinisk mikroarray / array CGH. Molekylära studier, såsom mikrosatellitanalys på föräldra-DNA eller metyleringsanalys på det drabbade barnets DNA, krävs för att detektera ursprunget till dup15q.

Standard för praxis är fortfarande att göra en FISH eller karyotyp för att bekräfta alla fall, eftersom kromosomer ibland kan verka på oväntade sätt.

Mikroarrayer

Microarrays är DNA-test som används för att mäta kromosomernas "kopieringsnummer". De skärmar för duplikationer eller raderingar, benämnda "kopieringsvariationer" för alla kromosomer och kan vanligtvis avgöra hur många totala kopior av en kromosomregion som finns. Även om de ger mer exakta gränser för den duplicerade regionen än kromosomstudier, kan de inte alltid skilja mellan int dup (15) och idiska (15) kromosomer. Om mikroarrayen visar en duplicering utförs vanligtvis också kromosomstudier.

Karyotyp- eller kromosomstudie:

En kromosomstudie eller görs typiskt från blod eller vid fostervattensprov. Med denna studie räknas kromosomerna och paren matchas, könskromosomerna identifieras och sedan undersöks bandmönstret för att leta efter tecken på att det kan gå förlorade, extra eller omarrangerade kromosomer.
Detta är ett exempel på en kromosomstudie för en kvinna med en idisk (15) kromosom. Den extra idiska (15) kromosomen visas bredvid det normala paret av kromosom 15.

FISK-test

Ett andra test som heter FISH, som står för Fluorescence In Situ Hybridization, används för att ge mer exakt information om DNA som ingår i en duplicering. Detta test använder en fluorescerande DNA-bit som markerar en specifik fläck på kromosom 15 för att avgöra om den finns i dupliceringen och, i så fall, hur många kopior det finns. Interstitiella duplikationer av kromosom 15 kan vara svårare att upptäcka vid rutinmässig kromosomanalys men är tydligt identifierbara med hjälp av en 15q FISH-studie.

Metyleringsanalys

Metyleringsanalysen använder en kemisk modifiering av DNA för att skilja om duplicering sker på en kromosom som kommer från modern eller fadern. Testet utvecklades för användning i Prader Willi och Angelman syndrom, så att ett eller båda av dessa namn ofta är i testets namn.

Kopiera nummer och svårighetsgrad

Det finns ett brett spektrum av svårighetsgrad i utvecklingsproblemen hos individer med dup15q syndrom. Två barn med samma dup15q-kromosommönster kan vara mycket olika när det gäller deras förmågor. Recensioner av vetenskaplig litteratur visar inte någon uppenbar korrelation mellan dupliceringsregionens storlek och symtomens svårighetsgrad. De genetiska riskerna för de olika typerna av kromosom 15-duplikationer är inte desamma. Ytterligare information finns på sidan för varje typ av duplicering. Familjer bör alltid diskutera resultaten av sina genetiska studier med en genetikperson för att säkerställa korrekt tolkning.